隨著對環境保護逐步重視，在制藥化工上必須狠抓源頭，嚴格處理達標之后才能有效排放。制藥的種類成千上萬，從原料，半成品，成品等研發，生產，檢驗的過程中，都會產生大量的污廢水。產品的特性不同，過程中所產生的廢水也有很大差異。特別是化工廢水，處理難度特別大。因為在精細化生產過程中，中間品的結構很復雜，處理的過程不亞于研發它的過程。這就要求，在研發它的時候，必須有配套的解決它的方法出現。否則，就不要研發或生產它，不然的話，造成的危害是無窮的。從目前已經掌握的技術來說，制藥化工中產生了很多的廢水，都是有毒有害的，一般的生化技術是難以降解的。
